El cantón Atahualpa se ubica en la cordillera de Chillacocha, de las estribaciones de la Cordillera Oriental, perteneciente a la Provincia de El Oro, tiene una área de 281,9 Km2, está conformado por la Parroquia Urbana de Paccha, y Parroquias Rurales: Ayapamba, San José, Milagro, Cordoncillo y San Juan de Cerro Azul.
El cantón Atahualpa se encuentra ubicado en el centro de la Provincia de El Oro, en la Zona Geográfica 17 Sur y entre las siguientes coordenadas planas (Universal Transversal de Mercator):Norte: 9617000 m – 9596900 m; Sur: 655170 m – 629230 m.
Su altitud varía desde los 600 msnm en el sitio Puente de Buza, hasta 3200 msnm en los páramos de la Cordillera de Chinchilla.